舟山市商务局是主管国内外贸易、外商投资和对外经济合作工作的市政府工作部门。
根据《中共舟山市委办公室舟山市人民政府办公室转发中共浙江省委办公厅浙江省人民政府办公厅关于印发〈舟山市人民政府机构改革方案的通知〉的通知》(舟委办〔2010〕97号),设立舟山市商务局。