广东省蛋白质组学重点实验室位于第一军医大学(现为南方医科大学)科技楼,拥有装备完善的常规病理室、分子病理学研究室、细胞培养室、分子生物学实验室、转基因实验室、蛋白质组学实验室、体视学实验室,细胞信号转导研究室、活体微循环研究室、血管功能研究室、生物筛选中心等。