根据中共重庆市委办公厅、重庆市人民政府办公厅批准的《关于印发重庆市区县(自治县、市)地方税务局机构改革方案的通知》(渝委办108号),设置重庆市万州区地方税务局,为重庆市地方税务局垂直管理机构,主管重庆市万州区地方税收工作。