由贺云翱教授在2003年发起,由南京大学文化与自然遗产研究所、南京中山陵园管理局、南京文化遗产保护与利用研究会、《世界遗产》杂志社、华夏遗产网联合主办,论坛常务机构设于南京大学。
从第四届开始,澳门世界遗产促进会、澳门世界遗产旅游博览会组委会也成为主办单位之一,并与其他主办单位共同组成“世界遗产论坛组织委员会”。