卓尼土司的始祖大约在唐朝末年率其家族和十六部落离开西藏,经过几个世纪的辗转迁徙,在元末明初由四川若尔盖进入甘南的迭部地区。明永乐二年(1404年) ,卓尼土司先祖些地征服了迭部达拉18族。永乐十六年(1418年),以地献地投明,入京朝贡,被授为武德将军洮州卫指挥佥事世袭,为第一代土司。