六甲区位于台湾 台南市中央偏北,北临柳营区、东山区,东邻楠西区,西临下营区,南接官田区、大内区。
本区呈东西宽南北窄的长条形,东半部属中央山脉的一部分,地势较为崎岖,西半部则属嘉南平原,地势平坦,气候属热带季风气候。